Вопрос по трудовому праву

Долгая история, но, девченки, больше не к кому обратиться. В общем ситуация сложная.
Вот что имеем. Сотрудник был в учебном отпуске (документы подтверждающие имеются), руководство отпуск должным образом не оформило. 34 дня сотрудник на работе не появлялся (приходил периодически по своим делам), но за все это время ему не было вынесено ни дисциплинарного взыскания, ни выговора, и на работу его ни кто не вызывал. По истечении 34 дней сотрудник был вынужден написать заявление по собственному желанию. Должна ли организация оплатить эти 34 дня, и если должна то по какому закону (и если нет то соответственно тоже)? Каким образом в таком случае работает бухгалтерия - сотрудник числится, а деньги не капают?