Что с этим делать?

да вообще креатива всякого полно, например, можно вообще красным цветом (или какой у вас там есть в интерьере) сердце забубенить, типа здесь живет любоффф.... я бы мужа прибила )))

а можно выдернуть еще несколько ниточек тоже с промежутками см 15 и разной  длины — рисунок получится, а не дырка...

если сильно заморочиться, можно купить кусочек из обрезков того же ковролина или опять же контрастного, наложить на это место, вырезать (знаете, как делают заплатки на обоях) одновременно прорезая оба слоя, потом лишнее снизу вынимаете — верхний новый слой вклеиваете, вот только ковролин сложно режется по месту, наверное...

можно вышить контрастной ниткой шерстяной толстой темно-коричневой такие разной глубины(длины) полоски, типа разводы от порога в глубину комнаты, не часто, см через 10-15...

снимайте порог, выдергивайте нитку из обрезков и занимайтесь вышивкой! Тут всего 4 ряда, и стежки по диагонали делайте, затем приуютюжить с паром через проутюжильник. На будущее — никогда не следует сверлить через ковролин.Удачи!!!!

Можно положить детский массажный коврик у входа. Наподобие такого. Только не знаю, как он ляжет на ковролин.

Я бы взяла кусок плотной хб материи, что бы не сыпалось! Есть такая ткань — для подушек и матрасов ее использовали раньше. Одела эту ткань в пяльца.(круги для вышивки) из остатков ковролина — выдернула нитку. Вставила нитку в иголку с большим ушком. И принялась вышивать на ткани, плотные буклированные стежки, имитирующие ваш ковер. сделала заготовку больше по размеру чем "дырка на 1 мм по всему краю. далее отстригла лишнюю ткань, оставляя чуть ткани на загиб. Дальше взяла бы маленькую иголочку тоненькую ниточку и загнув припуск во внутрь (под вернуть на изнанку) прошлась маленькими стежочками 0.5-1 мм. Получила бы в конце плотную вязаную полосочку . Сходила в магазин купила клей, и приклеила эту полосочку в дырочку. Сначала будет бросаться в глаза разница в рисунке, потом примнется и ни чего не будет видно. Перед тем как приклеивать аккуратно пришить край — тот который соприкасается с порожком. потом намазать клеем и приклеить. Не берите секунду. Лучше возьмите какой нибудь клей для склеивания обуви прозрачный. 

отавте как есть  ,через пару дней перестанете замечать 

Ничего вы не заштопаете и не приклеете, все вмиг оторвется на пороге. Подберите маленький коврик (типа ковриков в ванную) и положите у порога, типа так и задумано. 

в реале это наверное несколько см. Оставьте как есть, в доме должны быть небольшие изъяны и пусть это будет самой большой вашей проблемой :)