Подскажите, как правильней

обычно у педиатра меряют стоя, у нас тоже так лежа 84 см, стоя намерили 82, записали в карту 82

Можно и так и так. Но обычно у тех, кто уже стоит, меряют стоя. разница обусловлена изгибами позвоночника и осанкой. Когда человек лежит, он вытягивается, а когда стоит, за счет осанки немного проседает. Считайте рост стоя всегда и не заморачивайтесь).

рост меряют стоя.

Рост лёжа всегда больше

Стоя - рост, лёжа - длина.