Что делать если школьная медсестра угрожает не допустить ребенка на уроки без пробы Манту.

Однако очень часто такой отказ просто не хотят принимать. Кстати, в таком случае его можно послать на имя директора школы заказным письмом с уведомлением.

Не расстраивайтесь. Пусть не принимает - в первую очередь сама и получит по "шапке" в санстанции.
Дело в том, что для того, чтобы сделать Манту её нужно Ваше информированное согласие, которого Вы ей не давали. Сделать Манту без него или подделать согласие - чистой воды криминал (не забудьте ей напомнить что Вы с радостью засудите её в этом случае).

Формально школьная медсестра вообще не имеет никакого отношения к отстранению от занятий - это прерогатива дирекции школы или СЭС. Причём отстранение ОБЯЗАТЕЛЬНО должно быть оформлено в письменном виде. Скорее всего такое письменное отстранение никогда не появится, так как это основание для жалобы в прокуратуру, кучи проверок. Оно им надо?
На практике обычно помогает разговор "по душам": Вы доверительным тоном (степень доверительности зависит от степени адекватности медсестры) говорите медсестре, что Вы её прекрасно понимаете, сочувствуете ей (ведь она находится между молотом в лице СЭС и наковальней из нарушаемых ей законов). Однако ни в какие СЭС, туберкулезные диспансеры не поедете и Манту делать не будете.
Всё, что Вы можете для неё сделать - это написать отказ, чтоб ей было чем прикрыться в СЭС. (На самом деле это её обязанность ехать с Вашим отказом и регистрировать его в СЭС). Вот и говорите ей с нажимом и глядя прямо в глаза, что без Вашего согласия она не не имеет права проводить медицинские манипуляции с Вашим ребенком. А в школу ребёнок будет ходить, пока Вы не получите официальный письменный приказ об отстранении. Ну а уже с этим приказом Вы не поленитесь и в областную прокуратуру и в облОНО и в облЗдрав у Вас просто выхода другого не будет. Вы будете вынуждены реагировать на ущемление законных прав Вашего ребенка. В частности конституционного права на образование. Так что предложите её с улыбкой перестать заниматься глупостями и не усложнять друг-другу жизнь.

PS: Ну а ребенка научите не даваться в руки школьной медсестре. С полным правом орать, вырываться, драться и кусаться - именно в такой последовательности. Обычно хватает первых 2 пунктов.