Я беспокоюсь...

Мы когда такие маленькие были тоже плакали перед тем как пописать (с покаками отдельная была тема, там вообще все сложно оказалось). Переживала, думала что инфекция мочевых путей какая. Когда сдали мочу оказалось все в норме. Сейчас такого нет, но все равно иногда беспокоится перед тем как пописать. Но мочу, конечно, все равно желательно сдать, только соберите ее правильно. 
По поводу плачей тоже не особо переживайте. Мы очень на погоду реагировали, да и сейчас по всякому бывает. Тем более, детские колики никто не отменял. Даже с хорошим стулом такое вплоне допустимо. 
Посмотрите, не слишком ли вы кутаете ребенка? Ему хватает жидкости? Возможно, большие потери жидкости, и моча концетрированная и желудочные соки от этого загущаются. 

У нас было тоже самое, сдали кал на дисбактериоз. Обнаружили гемолизирующую кишечную палочку. Немного успокоить помогала теплая пеленка на животик, массаж животика и обязательное выкладывание на живот перед кормлением. Расскажите вашему врачу, может она что то еще посоветует. Удачи. Растите здоовенькими.