Предложена врачом после 3-х пролётов ПГД. Выбираю СГГ.
Cравнительная геномная гибридизация (aCGH) aCGH - технология высокоразрешающего скрининга всего генома на предмет вариации числа копий отдельных его сегментов. (M Shinawi, S. W. Cheung. 2008 )
Другими словами: метод, позволяющий диагностировать анеуплоидии и микроструктурные хромосомные аномалии одномоментно во всех хромосомах
Преимущества:
• Высокая разрешающая способность ( >1000 раз по сравнению с одномоментно во всех хромосомах.
• Высокая разрешающая способность ( >1000 раз по сравнению с кариотипированием)
• Скрининг всех хромосом (по сравнению с FISH)
• Возможность количественной детекции участков хромосом и однородительских дисомий
• Автоматизация исследования • Объективность результатов
• Сокращенные сроки получения результата (1‐3 сут)
Возможности aCGH:
• Микроскопические хромосомные нарушения
- Анеуплоидия (включая мозаицизм)
- Несбалансированные транслокации
- Маркерные хромосомы
• Субмикроскопические нарушения
- Микроделеционные/ микродупликационные синдромы
- Несбалансированные субтеломерные перестройки (del, dup, der)
Ограничения метода aCGH
• Сбалансированные перестройки
- Реципрокные транслокации
- Инверсии
- Робертсоновские транслокации
- Реципрокные инсерции
• Несбалансированные перестройки за г р ц рр ани цей раз решения
- Точечные мутации
- Тринуклеотидные экспансии
- Делеции /дупликации (ниже границы чувствительности )
• Результаты оцениваются совместно с методами классической цитогенетики
Клиническое применение aCGH
• Предимплантационная диагностика
• Пренатальная диагностика
• Диагностика при невынашивании беременности
• Постнатальная диагностика при:
• ВПР • недифференцированной умственной отсталости • Моногенная Моногенная патология патология ( мышечная дистрофия дистрофия Дюшена ) • онкологической патологии
• Верификация результатов цитогенетических исследований aCGH - единственный на сегодня метод, позволяющий произвести точную количественную оценку микроделеционных и й 19 микродупликационных изменений одномоментно во всем геноме.
Технические ограничения aCGH для PGS/PGD
• Качество исходного материала
• Значимость отклонений
•Нарушения и особенности амплификации всего генома (WGA) клетки - Чувствителен к качеству исходного материала - Образование фрагментов 100‐1000 п.н. (ср.размер - 400 п.н.) - Амплификация 60‐80% генома - Амплификация разных участков происходит с разной эффективностью (преимущественная амплификация) - Неспецифическая амплификация Неспецифическая амплификация (из‐за образования вторичных структур за образования вторичных структур ДНК) - Наличие активной полимеразы после окончания реакции деградирует продукты амплификации продукты амплификации - При работе с одной клеткой не исключается allele‐drop‐out
Следствие:
• ~ 7% недиагносцированных эмбрионов •Фактическое разрешение для PGS/PGD от 2 ‐ 5 Мbp в зависимости от места расположения перестройки 23 зависимости от места расположения перестройки
•Детекция мозаицизма (от 30%) •Ограниченная возможность детекции полиплоидии
Выводы
• aCGH - единственный на сегодня метод, позволяющий исследовать одновременно весь геном на предмет макро‐ и микроструктурных и микроструктурных несбалансированных хромосомных аномалий
• aCGH не подменяет кариотипирование!
• В случае детекции перестроек «на границе чувствительности» метода необходима FISH‐ или/и ПЦР‐верификация верификация.
• Определение хромосомных изменений с неустановленной клинической значимостью не неустановленной клинической значимостью не должно идти в разрез с общепринятыми этическими и этическими и деонтологическими деонтологическими нормами.
Подробнее по ссылке.