Я бы не сказала что очень больно, но довольно таки неприятно, и по маленькому потом немного болезненно ходить, у меня на сроке 29 нед брали и из влагалища и из уретры, аж по 3-м направлениям сразу - бак посев ПЦР и еще какую-то фигню...
Все зависит от врача который берет анализ. У меня были разы, когда вообще не заметно брали, а пару раз брали так, что потом писькала с адской болью и кровью сутки.