Как сохранить в формате JPEG??

Вы сохраняете через: Файл-Сохранить как...?  Если нет, то попробуйте так. Вы, как я поняла, просто закрываете фото, когда обработали, выпадает окошко выбора формата, там действительно нет выбора джейпег.

режим цвета должен быть 8бит

нажми крайнюю нижнюю слева кнопку...потом повтори операцию сохранения

Или  нажми Слои - Объединить видимые. если не поможет, то возьми любую фотку другую и наложи эту на неё, потом объедини слои и сохрани. У меня тоже так было. даже не знаю почему.