Что-то я не пойму. 3 НДФЛ.

Сегодня заполняла через программку декларацию папе. Он в прошлом году продал квартиру за 1650000 руб. в собственности более 3 лет. Но почему-то в самой программе нет пункта с налоговым вычетом с продажи имущества , находящегося более 3 лет. Вот и выходит, что папе не нужно платить налог, а программа упорно считает, что должен с 650000 руб. Может я галочку где-то не там поставила? И еще хотела уточнить. Давно он покупал квартиру и уже использывалсвой имущественный налоговый вычет и получил возврат налога. Может быть теперь такое, что он не сможет получить опять его (вычет), так как сам факт освобождения от уплаты налога при продаже имущества, находящегося свыше 3 лет является налоговым вычетом? Данный вычет предоставляется всего один раз.