бухгалтеры СОС))) упрощенка 6 % у юриков?

На Налоговый кодекс. Пусть учит матчасть с той статьи, где начисляются и уплачиваются налоги.

Ст. 171 НК Вычетам подлежат суммы налога, предъявленные продавцом покупателю и уплаченные продавцом в бюджет при реализации товаров, в случае возврата этих товаров (в том числе в течение действия гарантийного срока) продавцу или отказа от них. Вычетам подлежат также суммы налога, уплаченные при выполнении работ (оказании услуг), в случае отказа от этих работ (услуг).

Вычетам подлежат суммы налога, исчисленные продавцами и уплаченные ими в бюджет с сумм оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), реализуемых на территории Российской Федерации, в случае изменения условий либо расторжения соответствующего договора и возврата соответствующих сумм авансовых платежей.

Если их «компания» не знает как считаются налоги и осуществляются вычеты, то пусть наймут бухгалтера, т.к. это будет дешевле чем если Вы пойдете в суд с иском о взыскании недоплаченной части суммы + штраф 50% от недоплаченной части суммы, неустойка 3% за каждый день просрочки + моральный вред. 

Я поняла вашу ситуацию, поэтому и говорю неправомерно.

Правильно сказала девушка выше, никаких убытков у него не будет, он подаст уточненку и ему пересчитают налог и вернут переплату.