лечить или не лечить

не знаю что делать. Нам 2,5 мес. У нас нашли эту гадскую клебсиеллу и стафилококк и педиатр написала нам лечение в 2 этапа(1 - нифуроксазид со смектой чтобы все это убить, 2- био-гая и хепель - чтоб желудок чем-то заселить) насколько я читала - это стандартная схема. Мы на ГВ. Стафилококк во время беременности я лечила, но видать не совсем вылечила. Так вот что меня смущает - ну пропьем мы этот курс, а дальше опять же грудью питаться будем и все по новой и еще у нас нет ни одной прививки только собираются их делать,то как это может отразиться. Напишите пожалуйста кто что знает или думает по этому поводу