На каком транспорте лучше?

Я бы однозначно выбрала самолет. Поезд-автобус-паром-автобус — это нереально долго! Сама  измотаетесь, и ребенок устанет (Вы ж наверное со старшеньким поедете?).

Машиной тяжело не меньше, да еще и на паром можно долго простоять: рейсовые автобусы без очереди идут, а вот машины...вроде как обещали беременных и с маленькими детьми пропускать вне очереди тоже, но как на деле — хз, вдруг таковой категории не мало окажется.

Насчет дороги от аэропорта до места, а почему 5 часов ехать? Вы в какой город поедете? Я из Симфера в Феодосию ездила на машине, это примерно 120км, ну в пределах 2-2,5 часов доезжали.

Да, еще что касается самолета, Вы раньше летали? Как переносили? У меня вот разницы не было что беременная, что не беременная, нормально, никаких проблем не возникло. Только когда летела в Египет (4 с лишним часа) ходила иногда по салону, т.к. долго сидеть было тяжеловато.

мой врач мне говорила, что лучше пару часов полета, чем тряска в машине или на поезде 24 часа, а то и больше, так что я за самолет. И еще, не забудьте взять с собой на отдых все необходимые препараты и защитные средства. Вот тут можете подсмотреть списочек того, что беременяшка должна иметь с собой на отдыхе, я сама по этому списочку собирала все нужности. 

Лучше самолет, я летала в 5 недель, 2 часа и на месте) тряска в поезде гораздо хуже может сказаться на вашем самочувствии. Тем более в современных самолетах нет сильного перепада давления.