В собственности менее 3х лет

видимо, никак не уйти. по сделкам купли-продажи недвижимости между родственниками налоговые вычету не применяются (письмо Минфина 03-04-05/9-899 от 26.07.2012)

1300, по итогам года обяз-но подается декларация, в которой вы указываете, что ваши расходы на приобретение данной квартиры составили как раз 1300 и прикладываете расписку (оригинал).но у инспектора при проверке может возникнуть вопрос,что купили вы у близкого родственника, почитайте  в инете по поводу отношений родства и купле-продажи имущества.

Сделки с занижением сейчас проходят очень часто. В договоре купли продажи указывается сумма 1300. То есть за что купили за то и продали. Дохода не получили соответственно налог платить не с чего. Многие банки проводят такие ипотечные сделки, занижают до любой суммы,но не менее суммы кредита. Вам это практически ничем не грозит. Это опасно для покупателя, потому как любая сделка по вторичке оспорима в течении десяти лет. Соответственно если сделку завернут вы обязаны будете вернуть покупателю только сумму по договору, все остальное на вашей совести. 

Если я не ошибаюсь, то если меньше 1 млн., то налог платить не надо.

ни как , из любых вариантов предусмотрен налог,а занижение суммы по сделке череват тем что если покупатель захочет оспорить сделку то вам придется вернуть сумму по договору.Один вариант пожалуй может сделать взаимозачет, если вы будете покупать в налоговом году другую собсвенность